L'UNEQ est dirigée par un conseil d'administration composé de sept écrivains élus au moment de la séance annuelle. Seuls les membres titulaires et les membres d'honneur peuvent faire partie de l'exécutif du conseil d'administration. Deux postes d'administrateurs sont toutefois ouverts aux membres associés.
Des élections permettent, chaque année, le renouvellement partiel du conseil. Cette formule a pour but d'assurer le suivi des dossiers et des politiques.
Les membres du conseil, élus pour un mandat de deux ans, renouvelable, sont responsables de la direction et de l'administration des affaires du syndicat.
Le conseil d'administration est actuellement composé des membres suivants : (les hyperliens renvoient aux fiches des membres sur l'Infocentre littéraire des écrivains).
présidente
vice-président
secrétaire-trésorière
administratrice et représentante des régions
administratrice
administratrice
PRÉSIDENTES ET PRÉSIDENTS DE L'UNEQ de 1977 À 2010
Mars 1977 - Mars 1979
Mars 1979 - Octobre 1980
Denis Monière
Octobre 1980 - Octobre 1982
Octobre 1982 - Novembre 1984
Novembre 1984 - Novembre 1986
Novembre 1986 - Novembre 1987
Novembre 1987 - Novembre 1996
Novembre 1996 - Novembre 1998
Novembre 1998 - Décembre 2000
Décembre 2000 - Novembre 2004
Novembre 2004 - Décembre 2010